২০১৭ সালে তিনি মুকুল রায় TMC ছেড়ে BJP-তে যোগ দেন। তাঁর এই দলবদল বাংলার রাজনীতিতে ব্যাপক প্রভাব ফেলেছিল। কৈলাস বিজয়বর্গীয়র ঘনিষ্ঠ সহযোগী হিসেবে বিজেপির সংগঠন মজবুত করতে মুকুল রায় বিশেষ ভূমিকা নেন। ২০১৯-এর লোকসভা নির্বাচনে দিলীপ ঘোষের প্রচার ও ‘মোদী হাওয়া’র পাশাপাশি বঙ্গে BJP-র ১৮টি আসন জয়ের নেপথ্যে মুকুলের সূক্ষ্ম সাংগঠনিক ব্লু-প্রিন্ট ও অভিজ্ঞতা বড় প্রভাব ফেলে বলে মত রাজনৈতিক বিশেষজ্ঞদের।