মাইক্রোওয়েভে কিছু খাবার গরম করা স্বাস্থ্যের জন্য অত্যন্ত ঝুঁকিপূর্ণ। বিশেষজ্ঞদের মতে, খোসাসহ ডিম গরম করলে বিস্ফোরণের আশঙ্কা থাকে। পালং শাক বা বাঁধাকপি গরম করলে নাইট্রেট ক্ষতিকারক নাইট্রাইটে রূপান্তরিত হয়, যা ক্যানসারের ঝুঁকি বাড়ায়। এছাড়া শুকনো লঙ্কা ওভেনে গরম করা ফুসফুসের জন্য বিপদজনক।

প্লাস্টিকের পাত্রে খাবার গরম করলে বিষাক্ত রাসায়নিক খাবারে মিশে হরমোনের ভারসাম্য নষ্ট করে। তাই সুস্থ থাকতে কাচ বা সিরামিকের পাত্র ব্যবহার করা জরুরি।